玉米淀粉藏在籽粒的胚乳中，与蛋白质结合紧密。湿法的第一步是亚硫酸浸泡，让籽粒软化、蛋白质与淀粉的结合松动——这一步小作坊可用温水长时间浸泡替代，时间延长至两到三天。
泡软的玉米先粗破碎，此时胚芽整粒浮起，可以撇出（胚芽是玉米油的来源，另作压榨）；然后细磨，浆料过筛分出纤维皮渣；剩下的淀粉与蛋白混合浆，靠沉淀速度不同分离——淀粉重先沉，蛋白轻在上。
大规模生产用旋流分离器反复洗涤，小作坊则靠多次兑水沉淀实现。判断分离是否到位，看沉淀后的分层：底层淀粉洁白紧实，上层液体清而不糊，中间不应有灰白的过渡层，那是蛋白没除净的标志。