大豆储存期最大的敌人是豆象：虫蚀粒外壳仅一两个小孔，内部已被蛀空或污染，泡豆时浮起、打浆时发苦。清选时筛与风都拿它没辙（虫蚀粒比重尚可），色选机靠高分辨镜头捕捉孔洞与虫蚀色斑，是主力方案。
虫蚀发生在仓储环节：新豆入仓前晒透（水分十二以下），入仓后拌惰性粉或定期翻仓低温处理。家庭存豆的土法三件套：冷冻杀虫（零下十八度四十八小时）、花椒包驱虫、密封隔氧。虫蚀率超过百分之一的豆批，榨油影响小，做豆腐则影响口感与出品率，渠道要分开。
大豆清选还要注意“青豆粒”与“病斑粒”：未熟青粒影响蛋白质溶出，做豆浆豆腐得率降；紫斑病粒带异味。这两类靠色选与人工手选双保险。