阴性杆菌和阳性杆菌的区别一般是染色差异、结构差异、治疗差异等。
1、染色不同：
细菌先通过碱性染料结晶染色，而经碘液媒染后，使用酒精脱色。在一定的条件下，部分细菌不脱色，部分可以被脱去颜色，因此可以将细菌分为两大类，不脱色类称为阳性杆菌，脱色类称为阴性杆菌。
2、结构不同：
阴性杆菌细胞壁的肽聚糖较薄，没有磷壁酸，但是存在外膜，而阳性杆菌细胞壁的肽聚糖较厚，有磷壁酸，但缺乏外膜。
3、药物敏感程度不同：
阴性杆菌对青霉素类不敏感，但是对四环素类、碳青霉烯类抗生素敏感，而阳性杆菌青霉素类抗生素较为敏感。
除以上常见的区别外，还有包含种类不同等区别，常见阴性杆菌有肺炎杆菌、痢疾杆菌和大肠杆菌等，而阳性杆菌有肺炎双球菌、链球菌、破伤风杆菌等。如有不适应及时就医，在医生的指导下进行针对性治疗。
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