苔藓物种多样性的研究方法常见的有以下几种：
野外调查：
样方法：在研究区域内设置一定大小和数量的样方，如边长为 0.5 米或 1 米的正方形样方，对样方内的苔藓植物进行采集、记录和统计，包括物种种类、数量、盖度等信息。例如在森林中，随机选取多个样方来调查苔藓植物多样性 410。
样线法：沿着特定的路线（样线）进行调查，记录样线两侧一定范围内苔藓植物的分布和种类等情况。这种方法适用于较大范围的初步调查，能够快速了解苔藓植物在不同生境中的大致分布。像在草原、山地等区域可以采用样线法 3。
标本采集与鉴定：
在野外选取不同生境，如森林底层、岩石表面、树干等位置，采集苔藓植物标本。采集时要注意记录采集地点、生境特征、海拔、经纬度等信息 147。
将采集到的标本带回实验室，借助显微镜等工具，依据苔藓植物的形态特征，参考相关的分类学资料和文献，对标本进行准确鉴定到种或属的水平 410。
数据分析方法：
多样性指数分析：常用的有 Shannon-Wiener 指数、Simpson 指数、Pielou 均匀度指数等。Shannon-Wiener 指数反映物种的丰富度和均匀度，数值越高表示多样性越高；Simpson 指数侧重反映物种的优势度；Pielou 均匀度指数衡量物种在群落中的分布均匀程度 4810。
β 多样性分析：包括 Cody 指数、Wilson-Shmida 指数等，用于评估不同生境或群落之间苔藓植物物种组成的差异程度和更替速率 410。
排序分析：如主成分分析（PCA）、对应分析（CA）等，可将多个变量（如环境因子和苔藓植物物种数据）进行降维处理，以揭示苔藓植物物种分布与环境因子之间的关系，便于直观地了解哪些环境因素对苔藓植物多样性影响较大 1。
分子生物学方法：
DNA 条形码技术：选取特定的基因片段作为条形码，对苔藓植物的 DNA 进行提取和测序，通过与已知物种的条形码数据库进行比对，快速准确地鉴定苔藓植物物种，尤其对于形态特征不明显或难以鉴定的物种具有重要作用 59。
基因测序与分析：对苔藓植物的全基因组或特定基因进行测序，研究其基因结构、功能和进化关系，从分子水平揭示苔藓植物的多样性和系统发育，为理解苔藓植物的适应性和进化历程提供依据 59。
环境因子监测：
测量研究区域的光照强度、温度、湿度、土壤 pH 值、水分含量等环境因子。例如使用光照度计测量光照强度，温湿度传感器记录温度和湿度数据 1。